MediaInfo говорит что этот MKV чересстрочный (Interlaced), но само видео показывает без (гребенки, расчески), гребенка есть только на финальных титрах.
При воспроизведении данного исходника я не использовал "Deinterlaced" фильтр.
На форумах спросил, сказали что видео прогрессивное "Progressive".
В общем я включил в ffdshow deinterlaced filter, на штатном фильтре мерцание исчезло, а вот рывки остались, менял какое из двух полей будет первое, не помогло, переключил на ffmpeg, заработало.
И все же мучает вопрос, почему на одной версии MPC-HC x64 при выкл Deinterlace видео показывало нормально.